Aiutare affrontare alcune delle sfide globali più urgenti è saldamente in agenda per Microsoft Research (MSR) - applicando la nostra esperienza, la profondità e l'ampiezza di competenze, i partenariati e la potenza del software per affrontare queste sfide. Nel caso di ricerca di un vaccino per l'HIV, tutto questo entra in gioco come stiamo applicando ad alta potenza di calcolo, combattere l'HIV con dati e forse sorprendentemente, utilizzando la nostra esperienza di costruzione di filtri anti-spam e-mail a trovare una soluzione.
Oltre 1,8 milioni di persone muoiono di HIV per cause legate ogni anno - circa 5.000 morti al giorno. Una delle grandi sfide per combattere l'HIV è che il virus è in costante mutamento, per evitare attacchi da parte del sistema immunitario - tanto che si può cambiare tanto in una persona infetta il virus dell'influenza ha registrato nel corso della storia. Questo rende estremamente difficile analizzare con precisione il virus e sviluppare terapie che attaccano i suoi punti deboli sfuggente. Ogni mutazione significa un'altra variabile per identificare e comprendere. A complicare le cose ancora di più, la risposta immunitaria individuale varia notevolmente, il sistema immunitario di alcune persone sono in grado di contrastare con fermezza il virus, permettendo loro di vivere per anni senza alcun trattamento, mentre altri si ammalano più rapidamente i loro corpi non riescono a resistere all'attacco invasiva.
Come in molti progetti di MSR, questo lavoro è stato intrapreso in collaborazione con numerosi altri esperti del settore. Sperimentazione di un vaccino a Durban, in Sudafrica è guidata da Bruce Walker, presso il Ragon Institute presso il Massachusetts General Hospital, del MIT e Harvard, e un professore di medicina presso l' Università di KwaZulu-Natal . Essi sono uniti dalCentro per il Programma di Ricerca AIDS in Sud Africa e il KwaZulu-Natal Istituto di Ricerca per la tubercolosi e l'HIV . Questo programma di test genera grande quantità di dati, la cui analisi presenta un ostacolo enorme.
Ed è qui che David Heckerman e Jonathan Carlson di Microsoft Research con un strumento di Biologia Computazionale Microsoft chiamato PhyloD entrare Questo software consente efficiente di data mining che porta poi ad analisi cella specifica che aiuta i modelli virus dettaglio per ulteriori analisi. PhyloD strumenti contiene un algoritmo, codice e la visualizzazione di eseguire il riconoscimento complessi pattern e analisi - permette Heckerman ed i suoi colleghi per imparare come i diversi singoli sistemi immunitario rispondere alle molte mutazioni del virus.
Di solito la potenza di calcolo necessaria per elaborare il numero di variabili e possibili correlazioni sarebbero voluti anni, ma combinando lo strumento PhyloD con Microsoft ad alte prestazioni di centro di calcolo, questo lavoro può essere fatto in poche ore. Lavorare con i due gruppi, uno guidato da Christian Brander a Barcellona, e un altro guidato da Paul Goepfert presso la University of Alabama, Heckerman e il suo team hanno scoperto circa sei volte di più punti possibile attacco sul virus HIV, come era stato precedentemente identificato.
"Quando ci siamo incontrati la prima volta di Bruce, che aveva un problema molto difficile da analizzare", ricorda David Heckerman. "Aveva questo grande set di dati, ma non sapeva come analizzarlo. Ci è capitato di avere solo l'algoritmo giusto per esso e questa grande banca di computer a Microsoft che potrebbe fare questa massiccia quantità di calcolo. Ci ha dato il problema il Venerdì. Lunedi ', abbiamo avuto una analisi completa per lui ".
Quello che io personalmente trovo più affascinante di questo lavoro è che si basa sul precedente lavoro Heckerman si è impegnata a costruire un filtro spam. Gli stessi principi che vengono utilizzati per combattere lo spam in Hotmail, Outlook ed Exchange vengono utilizzati per combattere l'HIV. Sembra che vi sono molte somiglianze tra il modo in cui gli spammer si evolvono i loro approcci al fine di evitare filtri e il modo in cui il virus HIV è in costante mutamento.
Per quanto io amo il giorno di eccitazione giorno del nostro settore con nuovi dispositivi e nuovi software ha annunciato su base settimanale, è un lavoro come questo che trovo davvero stimolante. Come osserva Bruce Walker,
"Tutto ciò che impariamo qui sta per essere applicabile non solo per l'HIV, ma per cancro della mammella e della prostata, e finiranno per cambiare il modo in cui viene praticata la medicina"
Mi piace il ritmo e l'eccitazione della nostra industria e parte di Microsoft in questo - ma è anche gratificante sapere che io lavoro per una società che sta applicando il nostro cervello e la tecnologia alle sfide globali di questo tipo e cercando di cambiare veramente il mondo con la potenza di software.
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